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16S/18S/ITS扩增子测序

服务号:

ABF7112

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16S/18S/ITS扩增子测序

扩增子(amplicon)为DNARNA扩增后的一段核苷酸序列。比如通过PCR扩增得到的某个基因的扩增片段。扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。扩增子测序是一种高靶向性方法,用于分析特定基因组区域中的基因变异。扩增子测序能够根据不同需求,对目标区域进行高覆盖度的测序,还可以检测到低频突变。


扩增子测序主要包括16S rDNA测序、18S rDNA测序、ITS测序及目标区域扩增子测序等。16S/18S/ITS rDNA,序列包含可变区(Variable region)和保守区(constant region)。可变区序列因细菌而异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关,通过提取环境样品的DNA,并扩增和检测其中的一段或几段区域,可以了解环境样品中细菌的分类和丰度。


应用领域:

1.        癌症基因测序

2.        植物和动物测序

3.        疾病筛查


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