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16S/18S/ITS扩增子测序 | |
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扩增子（amplicon）为DNA或RNA扩增后的一段核苷酸序列。比如通过PCR扩增得到的某个基因的扩增片段。扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。扩增子测序是一种高靶向性方法，用于分析特定基因组区域中的基因变异。扩增子测序能够根据不同需求，对目标区域进行高覆盖度的测序，还可以检测到低频突变。
扩增子测序主要包括16S rDNA测序、18S rDNA测序、ITS测序及目标区域扩增子测序等。16S/18S/ITS rDNA，序列包含可变区（Variable region）和保守区（constant region）。可变区序列因细菌而异，且变异程度与细菌的系统发育密切相关，通过提取环境样品的DNA，并扩增和检测其中的一段或几段区域，可以了解环境样品中细菌的分类和丰度。
应用领域： 1. 癌症基因测序 2. 植物和动物测序 3. 疾病筛查
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