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基因测序平台
e生物界基因技术研究团队的目标是提供高品质的新一代测序及高通量基因芯片服务。随着需求的不断增加,我们的服务质量迅速提升,公司率先更新了包括主流的NGS和基因芯片在内的技术平台。目前,我们的高级生物信息学家利用我们购自Illumina公司的HiSeq2000 / 2500,Illumia Miseq,Ion Torrent PGM,PacBio RS和ABI 3730 / 3730XL等分析仪,已经解读测序超过一万份的序列,并积累了丰富的经验。我们将继续努力为您提供可匹敌制药和生物技术公司可靠性的服务,同时满足学术界和政府机构为对所有测序或阵列需求的目的。
2010年,我公司分子生物学的研究和发展继续扩展其服务。我们已经成为测序,基因芯片分析,基因库建设和基因分型服务的优质全球提供商,当然,我们的发展与进步离不开我们大集团客户的支持。
经过近十年的艰苦创业,依靠我们的专业工作团队,我们的业务范围横跨50多个国家和地区,充分满足国内和国外的客户,我们为此感到自豪。我们将始终致力于为您提供最专业的服务。
ABI3730xl DNA分析仪是一个完全自动化的96-毛细管电泳仪。为确保高品质的碱基读取,拼接和SNP检测,安必齐公司采用软件和人工读取相结合的方法以保证测序质量。 我们的高级生物信息学家月度分析过超过一万件序列信息,并积累了丰富的经验。
48毛细管3730 DNA分析仪是中到高通量基因分析领域里的黄金标准。使用3730 DNA分析仪进行DNA片段分析应用包括微卫星,扩增片段长度多态性,单核苷酸多态性分析,突变检测和传统的DNA测序。以最少量的样品获得最高质量的数据。
亮点:
•较高的光灵敏度和先进的聚合物,使您以更低的成本获得更高质量的数据。
•多种自动化功能,减少代价高昂的人为错误。
•优化聚合物提高工作效率的同时不会降低的结果。
•执行各种测序和片段分析应用,包括重测序,微卫星分析,AFLP,LOH,SSCP,SNP筛选和SNP验证
我公司引进的下一代测序仪罗氏454 GS-FLX +。 该仪器空前的灵敏度和可靠性范围将使我们得以在高通量测序应用中实现包括但不限于以下服务:
微生物全基因组测序
BAC测序
宏基因组学
突变的发现
miRNA的发现
cDNA文库筛选
我公司可根据来自客户端的具体需求提供量身定制的解决方案。 用于管理和分析任何下一代测序计划的重要组成部分,项目经理将被分配到每个任务。 具体而言,我公司能够提供定制的生物信息学注释和咨询,帮助客户最大限度地提高数据的信息提取。
亮点:
•更长的碱基读长:总碱基的85%来自对超过500个碱基的片段读取; 单次可读取的最长片段长度最长可达1 kb
•每次运行信息产量增加:较长的读取增加了测序通量,提高了整体运行的经济性
•改进从头组件:用较少的间隙生成更准确的组件,再重叠群,更好地分配重复区域
•更全面的结果报告:长的单跨读取多个外显子进行更完整的全长从头成绩单重建
该HiSeq 2500系统是最新加入到音序器的革命HiSeq家庭。 HiSeq 2500能够高输出的运行模式和快速周转运行模式之间进行切换。 在高输出模式下,HiSeq 2500实现了大量的测序基因组 ,exomes,或转录在一个单一的运行,允许大型研究,以最少的运行来完成。 在快速的运行模式下,HiSeq 2500能够测序30×基因在一天或完成或快复用的应用,如外显子组测序或RNA的序列中。 的快速运行时包括自动化的,上仪表生成和配对末端测序,与需要在整个过程中没有用户干预。
亮点:
• 前所未有的速度和灵活性
生成120GB数据只需27小时的快速运行模式,而选择高输出模式则数据大小可达600GB。
• 无与伦比的数据质量
成熟的SBS化学反应为潜在的临床应用提供最准确的结果。
• 最广泛的应用
可为不同研究规模提供各种应用,切实根据您的预算。
HiSeq 2500 Preliminary Performance Parameters |
|||
Performance Parameter |
High Output Mode |
Rapid Run Mode |
|
Read length (bp) |
2 × 100 |
2 × 100 |
2x150 |
Yield (Gb) |
~600 |
~120 |
~180 |
Run time |
~11 days |
~27 hours |
~39 h |
Bases > Q30 |
> 80% |
> 80% |
>75% |
Reads passing filter |
> 90% |
> 90% |
>90% |
Number of flow cells |
2 |
2 |
2 |
Lanes/flow cell |
8 |
2 |
2 |
Cluster generation |
cBot |
onboard |
onboard |
MiSeq是能够在单次运行中产生2×300配对碱基读取并产生高达15Gb数据的唯一台式测序仪。 这使得针对小基因组或目标变型的组装检测具有无与伦比的精确度,尤其是在均聚物的区域。 现在该仪器甚至可以在更短的时间内处理更多的样品,而每次运行读取产生比以前的版本更多的数据。 所有这一切都可以用最短的样品与数据流的台式定序来实现。
应用MiSeq,您可以:
•访问由超过 3800名化学界同行评议的关于准确测序化学的世界上最广泛的出版物支持
•高达96个样品的单次运行量,以提高效率
•获取准确的双向扩增子测序
•生成更完整的从头组装
可根据应用,灵活和扩展NGS系统
该NextSeq 500测序系统提供更快速、更简洁、更直观的高通量测序服务。 快速集成的从样品采集到结果出具的工作流程使许多测序应用,包括exomes,全基因组,转录分析在一个运行中实现。NGS系统可无缝融入研究实验室,而无需专门的设备。 现在,研究人员可以执行对高端和中端通量测序应用程序的任何组合,以促进他们的研究。
Hiseq X测序亮点:
•前所未有的速度和吞吐量:针对全基因组测序,生成1.6-1.8Tb数据量的时间 <3天。
•卓越的数据质量:高精度Illumina的测序通过合成(SBS)化学提供了经过验证的行业领先的数据质量。
•获取准确的双向扩增子测序
•人口尺度基因组测序:日最高通量为人口规模的项目提供了无法比拟的成本效益。
|
Mid-output |
High-output |
Key applications |
Everyday genome, exome, transcriptome sequencing, and more. |
|
Flow cells processed per run |
1 |
1 |
Output range |
20-39 Gb |
30-120 Gb |
Run time |
15-26 hours |
12-30 hours |
Reads per flow cell |
130 Million |
400 Million |
Maximum read length |
2 × 150 bp |
2 × 150 bp |
对于小型基因组测序,基因序列分布,芯片序列,和基因表达分析,Ion PGM用户可以选择3芯片密度即可实现最佳性能。
PGM™
技术支持快速简单,半导体芯片可扩展,Ion PGM™测序推出一种全新的方法来排序,使它更快,更方便。
Ion Proton™测序用户可以利用Ion Proton™ I芯片实现对exomes和全转录组测序,利用Ion Proton™ II芯片实现对人类基因组的测序,测序所需时间与Ion PGM™测序仪几乎相同。
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Ion Torrent PGM |
Ion Torrent Proton |
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Chip Type |
PGM 314 |
PGM 316 |
PGM 318 |
Proton I |
Proton II |
# of sensors |
1.3M |
6.3M |
11M |
165M |
660M |
Total output |
10-40Mb |
100-400Mb |
~1Gb |
~10Gb |
~100Gb |
Run time |
1-2 hrs |
1-2 hrs |
1-2 hrs |
2.5 hrs |
2.5 hrs |
Read length |
up to 400bp |
~200bp |
up to 400bp |
~200bp |
~200bp |
Total reads |
up to 0.6M |
up to 3M |
up to 6M |
60-80M |
240-330M |
测序的速度和质量是前所未有的。
该PacBio RS II是一种单分子实时(SMRT)DNA测序系统,可提供最高的识别精度,准确性和最长的读取长度。 SMRT测序是理想的用于从头装配,遗传变异的表征,甲基化分析,微生物学等等研究的测序手段。
亮点:
•最高N50
•最少的重叠群
•检测结构变异
•实现99.999%的准确度
•基因组测序成本只有目前普遍方案1/10